RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 F5H5T6 163 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TSPAN3O60637 253 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC3Q13217 504 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GALNTL6Q49A17 601 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TM9SF1O15321 606 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 USP4Q13107 963 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CFAP73A6NFT4 308 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 DRGXA6NNA5 263 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 DCLK1O15075 740 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CNTN5O94779 1100 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TCF3P15923 654 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 HOXC13P31276 330 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 HTR7P34969 479 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CCDC63Q8NA47 563 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MCUQ8NE86 351 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SUSD6Q92537 303 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 AVILO75366 819 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GCATO75600 419 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 PIAS1O75925 651 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K6O95382 1288 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MT-ND3P03897 115 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 INHBAP08476 426 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GBE1Q04446 702 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ALFQ53S48 1182 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 BANPQ8N9N5 519 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LRRC39Q96DD0 335 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GGT7Q9UJ14 662 aa20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 APRTP07741 180 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GSTA2P09210 222 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LAMP2P13473 410 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SGSHP51688 502 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 BNIP1Q12981 228 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 C5orf22Q49AR2 442 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 FAXCQ5TGI0 409 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NETO2Q8NC67 525 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SPOCK2Q92563 424 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CFAP36Q96G28 342 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ALADP13716 330 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TPSB2P20231 275 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 FCARP24071 287 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TPSAB1Q15661 275 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 FITM2Q8N6M3 262 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ECT2Q9H8V3 914 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 RHOQP17081 205 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ADRA1DP25100 572 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NCALDP61601 193 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MGAT5Q09328 741 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms