RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CHPFQ8IZ52 775 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 BBS5Q8N3I7 341 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ALLCQ8N6M5 410 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF366Q8N895 744 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 FLCNQ8NFG4 579 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MAML1Q92585 1016 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 FATE1Q969F0 183 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MYO19Q96H55 970 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 EXOC2Q96KP1 924 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ACOX2Q99424 681 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NT5MQ9NPB1 228 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CKAP5Q14008 2032 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CFAP69A5D8W1 941 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 WASH3PC4AMC7 463 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NPC1O15118 1278 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ATP9BO43861 1147 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 IFNB1P01574 187 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DQB2P05538 268 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 EPHX1P07099 455 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ALADP13716 330 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-EP13747 358 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PRKCHP24723 683 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 FNTAP49354 379 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MAXP61244 160 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 LMNB2Q03252 620 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ITKQ08881 620 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 WASHC5Q12768 1159 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TEX44Q53QW1 395 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SDE2Q6IQ49 451 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZS52 159 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZVU0 165 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PGBD5Q8N414 524 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TEX26Q8N6G2 289 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CEP112Q8N8E3 955 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC89Q8N998 374 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KDM1BQ8NB78 822 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MNS1Q8NEH6 495 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PJA1Q8NG27 643 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ATL2Q8NHH9 583 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 AGAP3Q96P47 875 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NELL2Q99435 816 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KRT12Q99456 494 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 IL12RB2Q99665 862 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CEP44Q9C0F1 390 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM245Q9H330 911 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MTG2Q9H4K7 406 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 USP29Q9HBJ7 922 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 LHX3Q9UBR4 397 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SEPT3Q9UH03 358 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM221A6NGB7 291 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 F5H423 210 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 M0R296 226 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 MUSKO15146 869 aa8.64□□□□□ -1.03
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