RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 VPS11Q9H270 941 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MIOSQ9NXC5 875 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 VWA8A3KMH1 1905 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.36□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FAM159BA6NKW6 160 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MYO1CO00159 1063 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 NRP1O14786 923 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 KLF11O14901 512 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CREB3O43889 395 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SNX3O60493 162 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 EFCAB14O75071 495 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ANXA9O76027 345 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ALDH1A2O94788 518 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MT-ND3P03897 115 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 POLBP06746 335 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 VAV1P15498 845 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ERCC2P18074 760 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 BDNFP23560 247 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CCNCP24863 283 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 EPHB2P29323 1055 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 HADHAP40939 763 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MAGEA9P43362 315 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CDK7P50613 346 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SLC18A2Q05940 514 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 RING1Q06587 406 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 AP1B1Q10567 949 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MANEALQ5VSG8 457 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 HHATQ5VTY9 493 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SPATA21Q7Z572 469 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 NUP93Q8N1F7 819 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MZB1Q8WU39 189 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 C1orf74Q96LT6 269 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 IL22Q9GZX6 179 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 IL37Q9NZH6 218 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TBK1Q9UHD2 729 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MID2Q9UJV3 735 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 MAFFQ9ULX9 164 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.35□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 AOC2O75106 756 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TADA2AO75478 443 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 DCTN3O75935 186 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 USP1O94782 785 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CXCL10P02778 98 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 KRT4P19013 534 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 DNAJB1P25685 340 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 PTPN3P26045 913 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ALDH3A1P30838 453 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SSTR1P30872 391 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 BRCC3P46736 316 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 OR1G1P47890 313 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 NDST2P52849 883 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 SEC24CP53992 1094 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CREMQ03060 361 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 CDK18Q07002 472 aa8.34□□□□□ -1.07
CTXN3-204ENST00000620385 TNK2Q07912 1038 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms