RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 C2CD6Q53TS8 623 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 CDCP2Q5VXM1 449 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 APOLD1Q96LR9 279 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 HEPHQ9BQS7 1158 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ZYG11BQ9C0D3 744 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ATP13A1Q9HD20 1204 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 FADS3Q9Y5Q0 445 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.42■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 TK2O00142 265 aa25.41■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF542PQ5EBM4 170 aa25.41■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 TAF3Q5VWG9 929 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ARCQ7LC44 396 aa25.41■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 FAM181AQ8N9Y4 354 aa25.41■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 POM121BA6NF01 834 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8SH3BPF8 625 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 AP1G1O43747 822 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 DNA2P51530 1060 aa25.4■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 U3KQA8 63 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 K7ESM1 405 aa25.39■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 CD160O95971 181 aa25.39■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 NEBLO76041 1014 aa25.38■■□□□ 1.65
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PTPRF-216ENST00000617451 PLPP6Q8IY26 295 aa25.38■■□□□ 1.65
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PTPRF-216ENST00000617451 ATMQ13315 3056 aa25.37■■□□□ 1.65
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PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 MPOP05164 745 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ACVRL1P37023 503 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ATP11AP98196 1134 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf57Q0VDD7 668 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 MANEALQ5VSG8 457 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 NAA35Q5VZE5 725 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 PARGQ86W56 976 aa25.36■■□□□ 1.65
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