RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A52Q3SY17 297 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM174AQ8TBP5 190 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTL7AQ9Y615 435 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ILVBLA1L0T0 632 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SRGAP2O75044 1071 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 DXOO77932 396 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G2AP14555 144 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB7P26010 798 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS21P63220 83 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ARF5P84085 180 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TRNP1Q6NT89 227 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM71AQ8IYT1 594 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 IFI44Q8TCB0 444 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP23Q9BVJ7 150 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP44Q9C0F1 390 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 USP29Q9HBJ7 922 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CSF2P04141 144 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 NME1P15531 152 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 L1CAMP32004 1257 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FLT3P36888 993 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRB2P47870 512 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 LSSP48449 732 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TPRG1LQ5T0D9 272 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SMYD5Q6GMV2 418 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 RETSATQ6NUM9 610 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 XYLT1Q86Y38 959 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK15Q8TD08 544 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 HEPHQ9BQS7 1158 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCG4Q9H172 646 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE5Q9HCH3 593 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP13A1Q9HD20 1204 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF15Q9UIH9 416 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SCNN1AP37088 669 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 DNA2P51530 1060 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD6Q53TS8 623 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD16Q5EG05 197 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF783Q6ZMS7 281 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 PARGQ86W56 976 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 LSMEM2Q8N112 164 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 C18orf8Q96DM3 657 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 FEM1CQ96JP0 617 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ASCL3Q9NQ33 180 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 KALRNO60229 2985 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1G1O43747 822 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CD160O95971 181 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TGM2P21980 687 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 GNA12Q03113 381 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CFHR1Q03591 330 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN3Q16667 212 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 BNIPLQ7Z465 357 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP57Q96MR6 1250 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 HAPLN3Q96S86 360 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TM6SF2Q9BZW4 377 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ZYG11BQ9C0D3 744 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 EVA1BQ9NVM1 165 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BM21 787 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVH48-1M5A8F1 160 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINT1O43278 529 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP11B1P15538 503 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ABL2P42684 1182 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 RABIFP47224 123 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS3P57727 454 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVPABLB-1P60509 514 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC20A2Q08357 652 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ISXQ2M1V0 245 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 BROXQ5VW32 411 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 GUSBP11Q6P575 273 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF605Q86T29 641 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM131BQ86XD5 332 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 DRC7Q8IY82 874 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 GGT7Q9UJ14 662 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ITM2BQ9Y287 266 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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