RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CD86P42081 329 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 EPHA5P54756 1037 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAXP61244 160 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZXDBP98169 803 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52K2Q8NGK3 314 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 MGARPQ8TDB4 240 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPON2Q9BUD6 331 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP13A1Q9HD20 1204 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAN1C1Q9NR34 630 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 GFRA2O00451 464 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPN2P17706 415 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC24CP53992 1094 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 DSC2Q02487 901 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 PGBD5Q8N414 524 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARRDC2Q8TBH0 407 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 TADA1Q96BN2 335 aa29.54■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEPT3Q9UH03 358 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM49D1C9J1S8 452 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRM6O15303 877 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBL1XO60907 577 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CES3Q6UWW8 571 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASSF3Q86WH2 238 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNC5BQ8IZJ1 945 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPXM2Q8N436 756 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFATQ9P243 1243 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZWINTO95229 277 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM107AO95990 144 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP2P08253 660 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CA4P22748 312 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALG1LQ6GMV1 187 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 PKN3Q6P5Z2 889 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 LEMD2Q8NC56 503 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 DENND1AQ8TEH3 1009 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRAC1Q9NRG0 131 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP97Q9P2B7 532 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 H0Y626 953 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFAB1O14561 156 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGT1A9O60656 530 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYOGP15173 224 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 IRS1P35568 1242 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC18A2Q05940 514 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAMK1Q14012 370 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC14Q15048 493 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCSK7Q16549 785 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 BANPQ8N9N5 519 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHMP6Q96FZ7 201 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCT8L2Q96SF2 557 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC46A2Q9BY10 475 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 MUC3BQ9H195 1237 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGT1A7Q9HAW7 530 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGT1A10Q9HAW8 530 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGT1A8Q9HAW9 530 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 DPP7Q9UHL4 492 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 HELZP42694 1942 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SOBPA7XYQ1 873 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF15O94989 841 aa29.51■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC14A2Q15849 920 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CARNMT1Q8N4J0 409 aa29.51■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZSCAN26Q16670 478 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 PACS1Q6VY07 963 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAX1BP1Q86VP1 789 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 CKAP2Q8WWK9 683 aa29.51■■■□□ 2.31
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 TXNDC16Q9P2K2 825 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 TM9SF1O15321 606 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 XYLBO75191 536 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERVK-10P10266 1014 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADRA1DP25100 572 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIFABQ6ZNK6 161 aa29.5■■■□□ 2.31
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