RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566286.5

TCF4-232, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 2,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-232ENST00000566286 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.14□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.14□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CDYLQ9Y232 598 aa11.14□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 USP3Q9Y6I4 520 aa11.14□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 SQORQ9Y6N5 450 aa11.14□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 A0A0J9YVX5 310 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 F5H423 210 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 NEMP1O14524 444 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CFLARO15519 480 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ZNF23P17027 643 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PSMB4P28070 264 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 SLC5A2P31639 672 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PDK1Q15118 436 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 AGR3Q8TD06 166 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 AGAP3Q96P47 875 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 IL22Q9GZX6 179 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 SPON1Q9HCB6 807 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 BFARQ9NZS9 450 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.13□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 E2F8A0AVK6 867 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CABYRO75952 493 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 C2P06681 752 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 GOT1P17174 413 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 EDNRBP24530 442 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 EPHA3P29320 983 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PHKA2P46019 1235 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PKNOX1P55347 436 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CDKL1Q00532 357 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 MS4A2Q01362 244 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 FAM187BQ17R55 369 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 DLK2Q6UY11 383 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 STRADAQ7RTN6 431 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 EDEM1Q92611 657 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TOP1MTQ969P6 601 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 EME1Q96AY2 570 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 OSBPL11Q9BXB4 747 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 DPP3Q9NY33 737 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TRIM38O00635 465 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ACOT8O14734 319 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PDPK1O15530 556 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 MFSD11O43934 449 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TRPA1O75762 1119 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CHRNGP07510 517 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TFEBP19484 476 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 SOX9P48436 509 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 GK3PQ14409 553 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 PPP2R5DQ14738 602 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CES3Q6UWW8 571 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TMEM135Q86UB9 458 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 LRRC43Q8N309 656 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CCDC185Q8N715 623 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 SVIPQ8NHG7 77 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ASB9Q96DX5 294 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 ZNF597Q96LX8 424 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 CCT7Q99832 543 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.12□□□□□ -0.63
TCF4-232ENST00000566286 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms