RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.64■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.64■■□□□ 1.06
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VNN2O95498 520 aa21.64■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TEX26Q8N6G2 289 aa21.64■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RANBP9Q96S59 729 aa21.64■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.64■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAMP2O60895 175 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VAPBO95292 243 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KITP10721 976 aa21.63■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DUSP4Q13115 394 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRM3Q14832 879 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ICE2Q659A1 982 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IGSF8Q969P0 613 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CD248Q9HCU0 757 aa21.63■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM114B3SHH9 223 aa21.62■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TLR5O60602 858 aa21.62■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HMBSP08397 361 aa21.62■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCND1P24385 295 aa21.62■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITKQ08881 620 aa21.62■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.62■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.62■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.62■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TREX1Q9NSU2 369 aa21.62■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 J3KR12 359 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITM2AO43736 263 aa21.61■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEPT6Q14141 434 aa21.61■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CALML6Q8TD86 181 aa21.61■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RILPQ96NA2 401 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC78A2IDD5 438 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABCG1P45844 678 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGA9Q13797 1035 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCSK7Q16549 785 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR6Y1Q8NGX8 325 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GIPC2Q8TF65 315 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMG2Q969U7 264 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF358Q9NW07 568 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.61■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM13O60858 407 aa21.6■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AHSGP02765 367 aa21.6■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SERPINA6P08185 405 aa21.6■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TACR2P21452 398 aa21.6■■□□□ 1.05
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRABP2P29373 138 aa21.6■■□□□ 1.05
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