RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	EDIL3	O43854	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NBN	O60934	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZBED4	O75132	1171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TCEA3	O75764	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CNMD	O75829	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	WDR47	O94967	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MMP1	P03956	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ICAM1	P05362	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FPR3	P25089	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ITPKB	P27987	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NAPA	P54920	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NLRP5	P59047	1200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PSG6	Q00889	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MTAP	Q13126	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZACN	Q401N2	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	USH1G	Q495M9	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PRR16	Q569H4	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934		J3KTA2	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MEIS2	O14770	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CA12	O43570	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ASNA1	O43681	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	VIP	P01282	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NPS	P0C0P6	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	XBP1	P17861	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DRD4	P21917	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A2	P31639	672 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KRT2	P35908	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	INHBE	P58166	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	BLMH	Q13867	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM29	Q14134	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ACOX1	Q15067	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2S	Q16763	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	P3H1	Q32P28	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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