RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 AMACRQ9UHK6 382 aa8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.97□□□□□ -0.97
APH1B-210ENST00000560890 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SGK1O00141 431 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 BNIP3LO60238 219 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 TMCC1O94876 653 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 PEX11BO96011 259 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ITGAVP06756 1048 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CHRNA3P32297 505 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 IL12RB1P42701 662 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CSNK1DP48730 415 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ENPP2Q13822 863 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CYP1B1Q16678 543 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 MYLK3Q32MK0 819 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 TEX26Q8N6G2 289 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 MNS1Q8NEH6 495 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 FRS2Q8WU20 508 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 PTPRN2Q92932 1015 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 MYO19Q96H55 970 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 TEKT5Q96M29 485 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 AGAP3Q96P47 875 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 IL12RB2Q99665 862 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 GABRG3Q99928 467 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 IER2Q9BTL4 223 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 USP29Q9HBJ7 922 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 NT5MQ9NPB1 228 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 HCN2Q9UL51 889 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.96□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ANTXRLA6NF34 631 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 C5orf60A6NFR6 353 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 RNF103O00237 685 aa8.95□□□□□ -0.98
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APH1B-210ENST00000560890 PHF2O75151 1096 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 GCATO75600 419 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 IGSF6O95976 241 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 GSRP00390 522 aa8.95□□□□□ -0.98
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APH1B-210ENST00000560890 HLA-EP13747 358 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 HOXB2P14652 356 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 AOC1P19801 751 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 PRKCHP24723 683 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 PTPN3P26045 913 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 MAPK8P45983 427 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 KCNJ1P48048 391 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CXCL12P48061 93 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 FNTAP49354 379 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SCNN1BP51168 640 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 DGKEP52429 567 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 WASHC5Q12768 1159 aa8.95□□□□□ -0.98
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APH1B-210ENST00000560890 GRM3Q14832 879 aa8.95□□□□□ -0.98
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APH1B-210ENST00000560890 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 C4orf22Q6V702 233 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SYT13Q7L8C5 426 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SRLQ86TD4 932 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CNTD1Q8N815 330 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CEP112Q8N8E3 955 aa8.95□□□□□ -0.98
APH1B-210ENST00000560890 CCDC89Q8N998 374 aa8.95□□□□□ -0.98
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