RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 XKR3Q5GH77 459 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 FUT10Q6P4F1 479 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTSS1LQ765P7 747 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTC8Q8TAM2 541 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGF13Q92913 245 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHKBQ93100 1093 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCAMP4Q969E2 229 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 GJA10Q969M2 543 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 B3GALT6Q96L58 329 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.25□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARL5CA6NH57 179 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBC1D4O60343 1298 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSPAN1O60635 241 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRP3O75074 770 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYBP10242 640 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCM7P33993 719 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB1AP62820 205 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSSK4Q6SA08 328 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 C14orf80Q86SX3 495 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC51Q96ER9 411 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 BOD1Q96IK1 185 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 MLST8Q9BVC4 326 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR35Q9HC97 309 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIP11Q15643 1979 aa9.24□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABHD16AO95870 558 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCARP24071 287 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR1G1P47890 313 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CXADRP78310 365 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 NTHL1P78549 312 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 MXRA7P84157 204 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABHD18Q0P651 414 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTAPQ13126 283 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q4G0T1 1027 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 EMC10Q5UCC4 262 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 DAAM2Q86T65 1068 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PALB2Q86YC2 1186 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNNM3Q8NE01 707 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAD1Q99259 594 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDYLQ9Y232 598 aa9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF785A8K8V0 405 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 E9PLN8 166 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDKL5O76039 1030 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 TDP2O95551 362 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 AHSGP02765 367 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD72P21854 359 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP3A7P24462 503 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SHC2P98077 582 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRIK3Q13003 919 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGL2Q14314 439 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP41Q3LFD5 358 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8NA96 180 aa9.22□□□□□ -0.93
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDPRQ8NCN5 879 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.5 ms