RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549738.5

GNPTAB-205, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, human

TSL 4

Gene GNPTAB, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTAB-205	ENST00000549738	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CD180	Q99467	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SLC7A4	O43246	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TNFSF14	O43557	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	LATS1	O95835	1130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SLC4A1	P02730	911 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	MT-ND3	P03897	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	UROD	P06132	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CHRM4	P08173	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CLTB	P09497	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	AKR1A1	P14550	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	DES	P17661	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ABCD1	P33897	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ZXDA	P98168	799 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	E2F5	Q15329	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	EYA3	Q99504	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SIL1	Q9H173	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ABCC9	O60706	1549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	SYN3	O14994	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PER2	O15055	1255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	GOSR1	O95249	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PLAU	P00749	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	WNT1	P04628	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CHM	P24386	653 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	GSTM2	P28161	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	TACR3	P29371	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	PTH2R	P49190	550 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CCR9	P51686	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNPTAB-205	ENST00000549738	CDH15	P55291	814 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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