RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545688.5

SNHG1-224, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3

Gene SNHG1, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-224	ENST00000545688	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	KCNJ13	O60928	360 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	MMP3	P08254	477 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	DPP6	P42658	865 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	FSIP1	Q8NA03	581 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	TEX45	Q8NA69	505 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	RTP4	Q96DX8	246 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688		A0A087WYN8	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688		E7EVH7	732 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	EYA2	O00167	538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	KRT38	O76015	456 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	ZNF432	O94892	652 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CSF1	P09603	554 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	PRKAA2	P54646	552 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	BNC1	Q01954	994 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	ITM2A	O43736	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	STRN	O43815	780 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CBX6	O95503	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	PNPLA4	P41247	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	MVD	P53602	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	BLMH	Q13867	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	WDR62	O43379	1518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	LDB3	O75112	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CKMT1A	P12532	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	YWHAQ	P27348	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	MTNR1A	P48039	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	FOXO1	Q12778	655 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	IL25	Q9H293	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-224	ENST00000545688	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	SERPINI2	O75830	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	METTL18	O95568	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	PTPN9	P43378	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TUBA1B	P68363	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-224	ENST00000545688	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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