RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541102.1

LTBR-209, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LTBR, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-209ENST00000541102 TEAD4Q15561 434 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 EFHC2Q5JST6 749 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 RETSATQ6NUM9 610 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 LAYNQ6UX15 382 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 KIAA1328Q86T90 577 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 IL21RQ9HBE5 538 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.52□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 KCNK3O14649 394 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ALOX15BO15296 676 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 PRPSAP2O60256 369 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ZMPSTE24O75844 475 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 RARAP10276 462 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CEACAM1P13688 526 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CD59P13987 128 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 L1CAMP32004 1257 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CHRNA3P32297 505 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 DRD3P35462 400 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 GJC1P36383 396 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ADPRHP54922 357 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CNTN1Q12860 1018 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ACAP1Q15027 740 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 KIF19Q2TAC6 998 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 HLA-BQ31612 363 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CHST14Q8NCH0 376 aa14.51□□□□□ -0.09
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LTBR-209ENST00000541102 CCDC114Q96M63 670 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 GAREM1Q9H706 876 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 EBF2Q9HAK2 575 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.51□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.51□□□□□ -0.09
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LTBR-209ENST00000541102 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CREB3O43889 395 aa14.5□□□□□ -0.09
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LTBR-209ENST00000541102 CD48P09326 243 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 DESP17661 470 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 COMTP21964 271 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 EPHB2P29323 1055 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 MAPKAPK2P49137 400 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CCR5P51681 352 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CLCN6P51797 869 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ARF5P84085 180 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 SLC20A2Q08357 652 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ARSIQ5FYB1 569 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 PIP4P1Q86T03 277 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 NLRP14Q86W24 1093 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 HSPH1Q92598 858 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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LTBR-209ENST00000541102 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 LAMA1P25391 3075 aa14.5□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 RAMP2O60895 175 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 GJB3O75712 270 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 CER1O95813 267 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 TNNT1P13805 278 aa14.49□□□□□ -0.09
LTBR-209ENST00000541102 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
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