RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 TEKT5Q96M29 485 aa26.12■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa26.12■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 IER2Q9BTL4 223 aa26.12■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 TMEM245Q9H330 911 aa26.12■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 RNF103O00237 685 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 RNF40O75150 1001 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 GCATO75600 419 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 IGSF6O95976 241 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SEC13P55735 322 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 RAD51Q06609 339 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 WASHC5Q12768 1159 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SFTPA1Q8IWL2 248 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 CCHCR1Q8TD31 782 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SLCO2A1Q92959 643 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SPATA13Q96N96 652 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 MGME1Q9BQP7 344 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 FBRSQ9HAH7 460 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 STON1Q9Y6Q2 735 aa26.11■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ECEL1O95672 775 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 IL12RB1P42701 662 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 KCNJ1P48048 391 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 GRM3Q14832 879 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 STARD3Q14849 445 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 C2orf27AQ580R0 203 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 EMC10Q5UCC4 262 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 PID1Q7Z2X4 250 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 MAATS1Q7Z4T9 603 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 PJA1Q8NG27 643 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 OR2AP1Q8NGE2 309 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 FRS2Q8WU20 508 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 LRRN4Q8WUT4 740 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 GABRG3Q99928 467 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 NT5MQ9NPB1 228 aa26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 IFNB1P01574 187 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 COL9A1P20849 921 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ZBTB17Q13105 803 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 CARD16Q5EG05 197 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ALG1LQ6GMV1 187 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 IL17RCQ8NAC3 791 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 CLDN23Q96B33 292 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 PAK5Q9P286 719 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 HCN2Q9UL51 889 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SIT1Q9Y3P8 196 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 CKAP5Q14008 2032 aa26.09■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 TTC34A8MYJ7 566 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 K7ERQ8 282 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ALOX15BO15296 676 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 EPHX1P07099 455 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ITKQ08881 620 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 TTC27Q6P3X3 843 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ZNF567Q8N184 647 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 LRIG1Q96JA1 1093 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 AGAP3Q96P47 875 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 NUDCD1Q96RS6 583 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 FOXQ1Q9C009 403 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 PCDH9Q9HC56 1237 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 LHX3Q9UBR4 397 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 MMP17Q9ULZ9 603 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 ACTL7AQ9Y615 435 aa26.08■■□□□ 1.77
STIP1-208ENST00000540501 GOLGA6CA6NDK9 693 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 GOLGA6BA6NDN3 693 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 POP4O95707 220 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 HLA-DQB2P05538 268 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 GOLGA6DP0CG33 693 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 AP1S1P61966 158 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 PRPSAP1Q14558 356 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 SLC14A2Q15849 920 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 DSG4Q86SJ6 1040 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 PTPRN2Q92932 1015 aa26.07■■□□□ 1.76
STIP1-208ENST00000540501 KRT12Q99456 494 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms