RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PIK3CGP48736 1102 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ALDH9A1P49189 494 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC18A1P54219 525 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CTXN1P60606 82 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NOMO3P69849 1222 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC13A2Q13183 592 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PTK6Q13882 451 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PRKG1Q13976 671 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NEDD9Q14511 834 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RASA2Q15283 850 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC38Q5VT99 294 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 GJB7Q6PEY0 223 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 DAW1Q8N136 415 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PRELID2Q8N945 189 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MDM1Q8TC05 714 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 FBXO25Q8TCJ0 367 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RAPGEF5Q92565 580 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NUP85Q9BW27 656 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 DPH5Q9H2P9 285 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 STK32BQ9NY57 414 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RRN3Q9NYV6 651 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TBX20Q9UMR3 447 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.89□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 A0A1W2PRG0 241 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PPIP5K2O43314 1243 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 EXTL3O43909 919 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PAPLNO95428 1278 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TTC4O95801 387 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CALB1P05937 261 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ARP10275 920 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MYL4P12829 197 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CYP11B1P15538 503 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CHN1P15882 459 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 FPR1P21462 350 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PCSK1P29120 753 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCND2P30279 289 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MAPK4P31152 587 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MAP2K2P36507 400 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KIR2DL3P43628 341 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 GCLMP48507 274 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SEC24CP53992 1094 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 OAZ1P54368 228 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RRADP55042 308 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 IL9RQ01113 521 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MTM1Q13496 603 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RAB32Q13637 225 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC29A2Q14542 456 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MESDQ14696 234 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RTP5Q14D33 572 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SURF1Q15526 300 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TAF12Q16514 161 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNG2Q16589 344 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 XKR9Q5GH70 373 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.88□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF365Q70YC5 407 aa4.88□□□□□ -1.63
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