RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAV1Q03135 178 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MESP2Q0VG99 397 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DLG2Q15700 870 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM215Q68D42 235 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGBD5Q8N414 524 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TERB1Q8NA31 727 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RUBCNQ92622 972 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EXOC2Q96KP1 924 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSKH2Q96QS6 385 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FCRL5Q96RD9 977 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 8.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEMA3CQ99985 751 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFU1Q9UMS0 254 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTC34A8MYJ7 566 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUSKO15146 869 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PMPCBO75439 489 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANXA9O76027 345 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGSF6O95976 241 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRFP11831 508 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTHP32929 405 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD86P42081 329 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFRSF4P43489 277 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GEMP55040 296 aa8.63□□□□□ -1.03
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VSNL1P62760 191 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZP2Q05996 745 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEMA5AQ13591 1074 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPARCL1Q14515 664 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MORF4L2Q15014 288 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PON2Q15165 354 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCSK7Q16549 785 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CARD16Q5EG05 197 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR93Q6P2C0 686 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRLQ86TD4 932 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAF1Q8N7H5 531 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IPMKQ8NFU5 416 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC14L1Q92503 715 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPT1BQ92523 772 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ART4Q93070 314 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MGME1Q9BQP7 344 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEP44Q9C0F1 390 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOD2Q9HC29 1040 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LHX3Q9UBR4 397 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMAPO00193 183 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INSIG1O15503 277 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP9BO43861 1147 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERLIN1O75477 346 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GJB3O75712 270 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGTP01019 485 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERPINF2P08697 491 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLULP15104 373 aa8.62□□□□□ -1.03
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