RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNK16Q96T55 309 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TTC1Q99614 292 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RTKNQ9BST9 563 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNX15Q9NRS6 342 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYBUQ9NX95 663 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MIOSQ9NXC5 875 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TTC3P53804 2025 aa6.86□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM170AA1A519 330 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYCE1LA8MT33 242 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOLGA8RI6L899 631 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNK1O00180 336 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TPP1O14773 563 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BANF1O75531 89 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSPA4LO95757 839 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PGK1P00558 417 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGLV3-27P01718 113 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C2P06681 752 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SERPINF2P08697 491 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRT16P08779 473 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NFKB1P19838 968 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PGM1P36871 562 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VHLP40337 213 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COPAP53621 1224 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AQP5P55064 265 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDH4P55283 916 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ACVR1Q04771 509 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAD2Q05329 585 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 STX5Q13190 355 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLD1Q13393 1074 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITGA9Q13797 1035 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RCN2Q14257 317 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC6Q16204 474 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NEPROQ6NW34 567 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPGNQ6UW88 154 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAPH1Q70E73 1250 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DCLK2Q8N568 766 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EFHBQ8N7U6 833 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CNTD1Q8N815 330 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM13CQ8NE31 585 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 STYXQ8WUJ0 223 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DLG3Q92796 817 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TADA1Q96BN2 335 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TOX2Q96NM4 488 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGAP3Q96P47 875 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms