RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 FETUBQ9UGM5 382 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ST14Q9Y5Y6 855 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 NOTOA8MTQ0 251 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM114B3SHH9 223 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP99D6REC4 459 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 COL6A1P12109 1028 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PRAMEP78395 509 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 WASHC5Q12768 1159 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 MGAT5BQ3V5L5 792 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 LDLRAP1Q5SW96 308 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 KRT80Q6KB66 452 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 DMAC2Q9NW81 257 aa10.25□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 PRELID1Q9Y255 219 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 SNX9Q9Y5X1 595 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF10AO00220 468 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 AIM2O14862 343 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB14O43829 449 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ERBB2P04626 1255 aa10.25□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 CCT8P50990 548 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 IFITM2Q01629 132 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PERM1Q5SV97 790 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 NT5C1BQ96P26 610 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf21Q9HAI6 301 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 VPS45Q9NRW7 570 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PSMD11O00231 422 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ENPP3O14638 875 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TRPC1P48995 793 aa10.25□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 ZBED5Q49AG3 693 aa10.25□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.25□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC29A1Q99808 456 aa10.25□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PNPOQ9NVS9 261 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 GNPTGQ9UJJ9 305 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0U1RQF3 1178 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 AVILO75366 819 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 GNAO1P09471 354 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ELK3P41970 407 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 GRIA3P42263 894 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ADAM17P78536 824 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PMS2P3Q13401 168 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF699Q32M78 642 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 IL23RQ5VWK5 629 aa10.24□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 SEMA4DQ92854 862 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 FIZ1Q96SL8 496 aa10.24□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 STK39Q9UEW8 545 aa10.24□□□□□ -0.77
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TRPS1-211ENST00000520276 GPR32O75388 356 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL2O95198 593 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1AP35813 382 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 ETFBP38117 255 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 IDH3AP50213 366 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 TRAF2Q12933 501 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 SELENBP1Q13228 472 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1LQ5SGD2 360 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 CBWD2Q8IUF1 395 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-211ENST00000520276 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
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