RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TANKQ92844 425 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS50Q96JG6 964 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF354BQ96LW1 612 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSF3RQ99062 836 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF700Q9H0M5 742 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDCPQ9H6R7 721 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNB4Q9HAV0 340 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 STEAP1Q9UHE8 339 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSAT1Q9Y617 370 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM205AQ6ZU69 1335 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC154A6NI56 674 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC34A8MYJ7 566 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 RFPL3O75679 317 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 LY6G6DO95868 133 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL14EPLP0DKL9 152 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD99P14209 185 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 BPIP17213 487 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 VAMP1P23763 118 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 NTSR1P30989 418 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADORA2A-AS1P86434 159 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SATB1Q01826 763 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 OLIG2Q13516 323 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 EBI3Q14213 229 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM189A2Q15884 450 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3AR1Q16581 482 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6P435 159 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 GFRALQ6UXV0 394 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQCHQ86VS3 1027 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM219Q86XT9 240 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBED8Q8IZ13 594 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 BBS10Q8TAM1 723 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPT2Q8TD30 523 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSC4DQ8WTU2 575 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFAND2BQ8WV99 257 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM19Q96HH6 336 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST6GAL2Q96JF0 529 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDAC6Q9UBN7 1215 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS51Q9UID3 782 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMX2Q9Y320 296 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR32B1ATL7 298 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASA4BC9J798 803 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOCS3O14543 225 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 STRNO43815 780 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1D-16P01601 117 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNGP13051 313 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL4RP24394 825 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMARCA1P28370 1054 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIFRP42702 1097 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ID4P47928 161 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PGDP52209 483 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDH12P55289 794 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCA4Q14CN2 919 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 OASLQ15646 514 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMZ1Q400G9 498 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D9BQ66K14 1250 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLD3Q8IV08 490 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ODF3L1Q8IXM7 274 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2W6PQ8NHA6 318 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 IP6K1Q92551 441 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTBPQ96DY7 904 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3orf30Q96M34 536 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM2Q9C040 744 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYTL1Q9NRR1 136 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCF2Q9UG63 623 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL15A1P39059 1388 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO10Q9HD67 2058 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP10A1A4S6 786 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CIDEAO60543 219 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTN5O94779 1100 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL18RAPO95256 599 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYZAPP0CAP1 466 aa-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms