RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	MT-CO1	P00395	513 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	VDR	P11473	427 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SRC	P12931	536 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT13	P13646	458 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT39	Q6A163	491 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	KY	Q8NBH2	561 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC114	Q96M63	670 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	MIS12	Q9H081	205 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	VPS28	Q9UK41	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	LRBA	P50851	2863 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CENPE	Q02224	2701 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276		K7ERQ8	282 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	KLRC4	O43908	158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	NEK3	P51956	506 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	THOP1	P52888	689 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SGCG	Q13326	291 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	NKD1	Q969G9	470 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB20	Q9NX57	234 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	IL36A	Q9UHA7	158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FBN2	P35556	2912 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	IGLON5	A6NGN9	336 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	STMND1	H3BQB6	276 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	LEFTY1	O75610	366 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXO21	O94952	628 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ADRB3	P13945	408 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	RRM1	P23921	792 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	GTF2H1	P32780	548 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CENPC	Q03188	943 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ENPEP	Q07075	957 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	STK38	Q15208	465 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276		M0QYT0	321 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SNAP91	O60641	907 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT7	P08729	469 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	LIF	P15018	202 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	NR2F2	P24468	414 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	IRAK1	P51617	712 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	MLLT10	P55197	1068 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	PPARD	Q03181	441 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	TCEA2	Q15560	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	FHL5	Q5TD97	284 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAM53C-208	ENST00000511276	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25

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