RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 HMCESQ96FZ2 354 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 LRIG1Q96JA1 1093 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 BTBD6Q96KE9 485 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PPC4 97 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 LEFTY1O75610 366 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 GSRP00390 522 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 ERCC2P18074 760 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 NUDT1P36639 197 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT81Q14533 505 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 MINDY1Q8N5J2 469 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TEKT4Q8WW24 435 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 CHP1Q99653 195 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-210ENST00000505941 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.033e-7■□□□□ 9.2
SH3BP2-210ENST00000505941 PLK4O00444 970 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 KRIT1O00522 736 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 IGSF6O95976 241 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHV4-34P06331 123 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CTSLP07711 333 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM253P0C7T8 217 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 C21orf59P57076 290 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RHOAP61586 193 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NUMA1Q14980 2115 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DPYSL2Q16555 572 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 HDAC8Q9BY41 377 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RBSNQ9H1K0 784 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC32A1Q9H598 525 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PREBQ9HCU5 417 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DFFAO00273 331 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TMCC1O94876 653 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CER1O95813 267 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RARAP10276 462 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIA4P48058 902 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 METAP1P53582 386 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIK2Q13002 908 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MYLK3Q32MK0 819 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PPM1JQ5JR12 505 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 AGBL4Q5VU57 503 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NEK5Q6P3R8 708 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC19Q9H756 370 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SP110Q9HB58 689 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NENFQ9UMX5 172 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PROSCO94903 275 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDH8O95206 1070 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CD160O95971 181 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ITGB7P26010 798 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 IL1R2P27930 398 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NEK3P51956 506 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC14A1Q13336 389 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM131CQ96AQ9 280 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SERAC1Q96JX3 654 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DMTF1Q9Y222 760 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 WASF2Q9Y6W5 498 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GVT2 93 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TM4SF5O14894 197 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT7P08729 469 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SERPINB6P35237 376 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH6P55285 790 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM69Q86WT6 500 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 KCTD6Q8NC69 237 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ARRDC3Q96B67 414 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-210ENST00000505941 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms