RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 INSCQ1MX18 579 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PARP15Q460N3 678 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MARC1Q5VT66 337 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ARMC3Q5W041 872 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TPGS2Q68CL5 300 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KDELC1Q6UW63 502 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF778Q96MU6 729 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 AGAP2Q99490 1192 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SP110Q9HB58 689 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 VPS45Q9NRW7 570 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SZT2Q5T011 3432 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RAMP2O60895 175 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PMPCBO75439 489 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DCTN3O75935 186 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SEC24AO95486 1093 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TYK2P29597 1187 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINB8P50452 374 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DSG1Q02413 1049 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 IL10RBQ08334 325 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SERINC3Q13530 473 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ATG16L1Q676U5 607 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TDHQ8IZJ6 230 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DCLK2Q8N568 766 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PSMG2Q969U7 264 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 E2F7Q96AV8 911 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MYRFLQ96LU7 910 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf26Q96N11 449 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MECRQ9BV79 373 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NPHS2Q9NP85 383 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SNX15Q9NRS6 342 aa8.31□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 CHKBQ9Y259 395 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 F5H5T6 163 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TIMM44O43615 452 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ACSL4O60488 711 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GSRP00390 522 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 OR1E1P30953 314 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KCNQ1P51787 676 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 WNT3AP56704 352 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BST1Q10588 318 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 OVGP1Q12889 678 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 POU6F1Q14863 301 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SETDB1Q15047 1291 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NT5MQ9NPB1 228 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GBF1Q92538 1859 aa8.31□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 GJB5O95377 273 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MMP2P08253 660 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC6A4P31645 630 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NCALDP61601 193 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TMPRSS15P98073 1019 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 OCRLQ01968 901 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CHI3L2Q15782 390 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HECTD3Q5T447 861 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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