RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ADD2P35612 726 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 AVPR1AP37288 418 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 PNPLA4P41247 253 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 IL13RA2Q14627 380 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 BRD3Q15059 726 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TAF5Q15542 800 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RPE65Q16518 533 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 HLFQ16534 295 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ATG9BQ674R7 924 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 PALB2Q86YC2 1186 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SETD9Q8NE22 299 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 GOLGA1Q92805 767 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RTP4Q96DX8 246 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RNFT2Q96EX2 444 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 LMLNQ96KR4 655 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 IFT27Q9BW83 186 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 LHPPQ9H008 270 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CHODLQ9H9P2 273 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 BAG5Q9UL15 447 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NBNO60934 754 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 LDB3O75112 727 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SOX30O94993 753 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CLCNKBP51801 687 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NUDT6P53370 316 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MYBPC2Q14324 1141 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ME3Q16798 604 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 AADACL2Q6P093 401 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CUZD1Q86UP6 607 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 LMO3Q8TAP4 145 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 THAP4Q8WY91 577 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NR4A3Q92570 626 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 DUX5Q96PT3 197 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 A0A087WYN8 130 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 A0A1B0GUV1 79 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 IFITM10A6NMD0 228 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 J3KR12 359 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 IFNL4K9M1U5 179 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SLC16A5O15375 505 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 IGKV3-20P01619 116 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TK1P04183 234 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NAGAP17050 411 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 DCTDP32321 178 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 DPP6P42658 865 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 AMTP48728 403 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RPS6KA3P51812 740 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CDH12P55289 794 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ARHGAP8P85298 464 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 KIF5AQ12840 1032 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ARMC9Q7Z3E5 817 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SERPINA11Q86U17 422 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FSIP1Q8NA03 581 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MASTLQ96GX5 879 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.04□□□□□ -1.92
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