RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	PCK1	P35558	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CTSK	P43235	329 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TAS2R38	P59533	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HLA-B	Q31612	363 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NAXD	Q8IW45	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1W2PR77	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RASA4B	C9J798	803 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RASA4	O43374	803 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CD38	P28907	300 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MIP	P30301	263 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NDST2	P52849	883 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SERINC3	Q13530	473 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CA9	Q16790	459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	IL21R	Q9HBE5	538 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RNF103	O00237	685 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	FLRT2	O43155	660 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DFNA5	O60443	496 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TMCC1	O94876	653 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CYP1A2	P05177	515 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CCT8	P50990	548 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NEK3	P51956	506 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	C21orf59	P57076	290 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SHC2	P98077	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PDF	Q9HBH1	243 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	FRY	Q5TBA9	3013 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	BUB1	O43683	1085 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	AP1G1	O43747	822 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SH3BP5	O60239	455 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	IGSF6	O95976	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	WNT1	P04628	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ADRB3	P13945	408 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HCAR3	P49019	387 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DNA2	P51530	1060 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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