RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 RAB21Q9UL25 225 aa22.4■■□□□ 1.18
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PSPC1-204ENST00000492741 RHOAP61586 193 aa22.39■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SEMA5AQ13591 1074 aa22.39■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.39■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 TTC17Q96AE7 1141 aa22.39■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.39■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.39■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 CHFRQ96EP1 664 aa22.38■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 EXOC2Q96KP1 924 aa22.38■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 SRCP12931 536 aa22.37■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 RNF135Q8IUD6 432 aa22.37■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.35■■□□□ 1.17
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PSPC1-204ENST00000492741 BNIP3LO60238 219 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PMPCBO75439 489 aa22.35■■□□□ 1.17
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