RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 DPYSQ14117 519 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 AGBL4Q5VU57 503 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 DYRK4Q9NR20 520 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 C4orf47A7E2U8 309 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP33O14559 1287 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 LEFTY1O75610 366 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TMCC1O94876 653 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 GSRP00390 522 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 SYPP08247 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 MAPK8P45983 427 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 C10orf142B7Z368 130 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 RNF103O00237 685 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CCR5P51681 352 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 AFMIDQ63HM1 303 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 LZTR1Q8N653 840 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 NPWQ8N729 165 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ARRDC3Q96B67 414 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 J3KR12 359 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 AMPD1P23109 780 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 MAN1A1P33908 653 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 KRT81Q14533 505 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 KNL1Q8NG31 2342 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 HDAC8Q9BY41 377 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PDFQ9HBH1 243 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 INTUQ9ULD6 942 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PPC4 97 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 DFFAO00273 331 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 KRIT1O00522 736 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TM4SF5O14894 197 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 PRAMEF11O60813 436 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 IGSF6O95976 241 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ITGB7P26010 798 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 GJC1P36383 396 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CDH6P55285 790 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TAS2R38P59533 333 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 RHOAP61586 193 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 GRIK2Q13002 908 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 MESDQ14696 234 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 MYLK3Q32MK0 819 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.22■□□□□ 0.83
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