RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	HES3	Q5TGS1	186 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TMC6	Q7Z403	805 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	C14orf80	Q86SX3	495 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	OXR1	Q8N573	874 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	GANC	Q8TET4	914 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	WBP1	Q96G27	269 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	LGMN	Q99538	433 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	SGK2	Q9HBY8	427 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	COX16	Q9P0S2	106 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	NEU3	Q9UQ49	428 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ATM	Q13315	3056 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1B0GTQ1	180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	WASH4P	A8MWX3	477 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	VILL	O15195	856 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ALOX15B	O15296	676 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP9B	O43861	1147 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF8	O76064	485 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP1A2	P05177	515 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RHOQ	P17081	205 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	PRKCH	P24723	683 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CTSK	P43235	329 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	HCAR3	P49019	387 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	IRAK1	P51617	712 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TMPRSS3	P57727	454 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT83	P78385	493 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	IL9R	Q01113	521 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	OGDH	Q02218	1023 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CDO1	Q16878	200 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ALF	Q53S48	1182 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	HS1BP3	Q53T59	392 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	EFHC2	Q5JST6	749 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	APCDD1	Q8J025	514 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	BIRC7	Q96CA5	298 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF653	Q96CK0	615 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	MGA	Q8IWI9	3026 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTN5	O94779	1100 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	LRIG2	O94898	1065 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	GJB6	O95452	261 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RHOC	P08134	193 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ACSL1	P33121	698 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNC4	Q03721	635 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	USP30	Q70CQ3	517 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	PLPP6	Q8IY26	295 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC185	Q8N715	623 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	FRS2	Q8WU20	508 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	EPAS1	Q99814	870 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM5	Q9C035	493 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	MAGEH1	Q9H213	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	GDF3	Q9NR23	364 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	INTU	Q9ULD6	942 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	FZD10	Q9ULW2	581 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms