RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 NCAM2O15394 837 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ATP6V1G2O95670 118 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 LATS1O95835 1130 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 JCHAINP01591 159 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 GLDCP23378 1020 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PTPN3P26045 913 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 NDST2P52849 883 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 NCALDP61601 193 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SPARCL1Q14515 664 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CPT1BQ92523 772 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 STARD13Q9Y3M8 1113 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 RAD54BQ9Y620 910 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 NOTCH4Q99466 2003 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1B0GVM2 712 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CFAP69A5D8W1 941 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CLDN11O75508 207 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 GCATO75600 419 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 NQO1P15559 274 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TSHRP16473 764 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TAC1P20366 129 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PHBP35232 272 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CNTD1Q8N815 330 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ASB16Q96NS5 453 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ECT2Q9H8V3 914 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 A0A0A0MRY4 1105 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PPC1 479 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 H0Y626 953 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ASMTLO95671 621 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PEX11BO96011 259 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 GCAP28676 217 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 MAPKAPK2P49137 400 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PID1Q7Z2X4 250 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 DENND1AQ8TEH3 1009 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SPATA13Q96N96 652 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SMC6Q96SB8 1091 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SPON2Q9BUD6 331 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TRABDQ9H4I3 376 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ETNK1Q9HBU6 452 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CCNB1P14635 433 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CCNCP24863 283 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 GNA12Q03113 381 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 USP4Q13107 963 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ASIC4Q96FT7 647 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TSGA13Q96PP4 275 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PITPNM3Q9BZ71 974 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 NOD2Q9HC29 1040 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ATP5HO75947 161 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM63AO94886 807 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SERINC3Q13530 473 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 FYB2Q5VWT5 728 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 Q7L0L9 218 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PPIL6Q8IXY8 311 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 CPXM2Q8N436 756 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 MYADMQ96S97 322 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PAK5Q9P286 719 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SOBPA7XYQ1 873 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 MATN3O15232 486 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 RHOCP08134 193 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 PSMB4P28070 264 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 ARL4CP56559 192 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 WDR4P57081 412 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 OLIG2Q13516 323 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TEX44Q53QW1 395 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 IL31Q6EBC2 164 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPN3-209ENST00000466222 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms