RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 TUBP50607 506 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAJB13P59910 316 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 XIAPP98170 497 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 BTKQ06187 659 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SMARCB1Q12824 385 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 GRM3Q14832 879 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 GSTA3Q16772 222 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 C1orf146Q5VVC0 180 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 NUP93Q8N1F7 819 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 NETO2Q8NC67 525 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PEX13Q92968 403 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SIK2Q9H0K1 926 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 COG4Q9H9E3 785 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RGS18Q9NS28 235 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 OSER1Q9NX31 292 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 HACD3Q9P035 362 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 NOD1Q9Y239 953 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 MATN2O00339 956 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CA12O43570 354 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 KRT36O76013 467 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 AMHP03971 560 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 ASGR1P07306 291 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC26A3P40879 764 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CD151P48509 253 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC12A2P55011 1212 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 KLC1Q07866 573 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 HERC3Q15034 1050 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RANBP10Q6VN20 620 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 GPATCH11Q8N954 259 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR60Q8WVS4 1066 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 MIEF2Q96C03 454 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SERPINI1Q99574 410 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 FICDQ9BVA6 458 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 VCXQ9H320 206 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 TREX1Q9NSU2 369 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC7A8Q9UHI5 535 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 MGEA5O60502 916 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 TBX10O75333 385 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 ALDH1A1P00352 501 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PGK1P00558 417 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 GLDCP23378 1020 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CPA2P48052 419 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CLCN5P51795 746 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SATB1Q01826 763 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 C16orf89Q6UX73 402 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 IPMKQ8NFU5 416 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC39A13Q96H72 371 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.91■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.9■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 AHSGP02765 367 aa15.9■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 TPH1P17752 444 aa15.9■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 TM4SF4P48230 202 aa15.9■□□□□ 0.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms