RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 LRIG1Q96JA1 1093 aa23.42■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 THAP2Q9H0W7 228 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 EBF2Q9HAK2 575 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ACTL7AQ9Y615 435 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 WASF2Q9Y6W5 498 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 NCOR2Q9Y618 2525 aa23.42■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 DAPK3O43293 454 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 RASA4O43374 803 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 LRCH4O75427 683 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 GSRP00390 522 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 SLC6A18Q96N87 628 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 DMTF1Q9Y222 760 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 SNX11Q9Y5W9 270 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 CD38P28907 300 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 NDST2P52849 883 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PPP2CBP62714 309 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 SERINC3Q13530 473 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CA9Q16790 459 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 BOLA3Q53S33 107 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 RNF214Q8ND24 703 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 OR2AP1Q8NGE2 309 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 TM6SF2Q9BZW4 377 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 IL21RQ9HBE5 538 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 TM7SF3Q9NS93 570 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CHD5Q8TDI0 1954 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPN4-208ENST00000460289 KLC2Q9H0B6 622 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPN4-208ENST00000460289 ANAPC7Q9UJX3 599 aa23.37■■□□□ 1.33
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PTPN4-208ENST00000460289 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa23.36■■□□□ 1.33
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