RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CUL5Q93034 780 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMG2Q969U7 264 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SGSM3Q96HU1 749 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.612e-11■■■■■ 61.7
RABGGTB-203ENST00000459697 CPB2Q96IY4 423 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ACOX2Q99424 681 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 BOLA2Q9H3K6 86 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MSL2Q9HCI7 577 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GDF3Q9NR23 364 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ST7Q9NRC1 585 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 COPG2Q9UBF2 871 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO10Q9UK96 956 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 H7C4K7 107 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PLD2O14939 933 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 VILLO15195 856 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MAFGO15525 162 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FSBPO95073 299 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ADCY8P40145 1251 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DNM2P50570 870 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 IL13RA1P78552 427 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 RALBP1Q15311 655 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF77Q15935 545 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TAF12Q16514 161 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFB109BQ30KR1 87 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TXNDC8Q6A555 127 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NOTUMQ6P988 496 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DPH6Q7L8W6 267 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MRGPRGQ86SM5 289 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ITIH5Q86UX2 942 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO39Q8N4B4 442 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SKA1Q96BD8 255 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GPATCH3Q96I76 525 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM167AQ96KS9 214 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NUP58Q9BVL2 599 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NELFAQ9H3P2 528 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MINDY3Q9H8M7 445 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 IFT122Q9HBG6 1241 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ITM2CQ9NQX7 267 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MAFFQ9ULX9 164 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ASB3Q9Y575 518 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 FFAR2O15552 330 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRTM2O43300 516 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ERLIN2O94905 339 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 F9P00740 461 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GNAI2P04899 355 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP17A1P05093 508 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 HEXAP06865 529 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 THP07101 528 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ACADMP11310 421 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CKMT1AP12532 417 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 HGFP14210 728 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CD27P26842 260 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 UGT1A5P35504 534 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 MEOX1P50221 254 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCNKBP51801 687 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TLE4Q04727 773 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 GRM7Q14831 915 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NADK2Q4G0N4 442 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 VWA2Q5GFL6 755 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF280DQ6N043 979 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 NXPE1Q8N323 547 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR48Q8TAF3 677 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 IFI44Q8TCB0 444 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 CFHR4Q92496 578 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-203ENST00000459697 LENG9Q96B70 501 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.6 ms