RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442250.5

ITGA6-206, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ITGA6, Length 3,393 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-206ENST00000442250 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MBTPS1Q14703 1052 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DDR2Q16832 855 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 NXNQ6DKJ4 435 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PACS1Q6VY07 963 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 BHMTQ93088 406 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PLGRKTQ9HBL7 147 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 THEGQ9P2T0 379 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CSH1P0DML2 217 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CSH2P0DML3 217 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CCL5P13501 91 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CPB1P15086 417 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ATICP31939 592 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TTC3P53804 2025 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SLC18A2Q05940 514 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 POU5F1BQ06416 359 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PPP2R5DQ14738 602 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KBTBD6Q86V97 674 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DEFB106AQ8N104 65 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CCNYQ8ND76 341 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 JADE3Q92613 823 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 BCO2Q9BYV7 579 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 NUF2Q9BZD4 464 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ZNF358Q9NW07 568 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 USP18Q9UMW8 372 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 A8MU76 341 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PMM2O15305 246 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KPNA6O60684 536 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 LRCH4O75427 683 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CAPN15O75808 1086 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DDHD2O94830 711 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 BPGMP07738 259 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 COX4I1P13073 169 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 AOC1P19801 751 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SULT1E1P49888 294 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CRADDP78560 199 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TGFBIQ15582 683 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CA9Q16790 459 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TEX44Q53QW1 395 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 LHX8Q68G74 356 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 METTL23Q86XA0 190 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SPATA18Q8TC71 538 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PCED1BQ96HM7 432 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TNIP3Q96KP6 325 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 HIPK3Q9H422 1215 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CCDC78A2IDD5 438 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 FUOMA2VDF0 154 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 M0QYT0 321 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SERPINB7O75635 380 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KLHL2O95198 593 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GPD1P21695 349 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ABCG1P45844 678 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GPR15P49685 360 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 IDH3AP50213 366 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ZNF132P52740 706 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MS4A2Q01362 244 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TRIM60Q495X7 471 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 Q6ZNX1 250 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms