RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DLX3O60479 287 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ALDH1A2O94788 518 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXO21O94952 628 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 STAMBPO95630 424 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 EDNRBP24530 442 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 YWHAQP27348 245 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPN9P43378 593 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MAXP61244 160 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LSAMPQ13449 338 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRE1Q14246 886 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OSTM1Q86WC4 334 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MIPOL1Q8TD10 442 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SNAPC2Q13487 334 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NUP93Q8N1F7 819 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OXSMQ9NWU1 459 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RAP2CQ9Y3L5 183 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF711Q9Y462 761 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 I6L893 689 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MATN2O00339 956 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM18P0DKX4 95 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CES1P23141 567 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LIPMQ5VYY2 423 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF786Q8N393 782 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM96AQ9H5X1 160 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SUPT7LO94864 414 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PKDCCQ504Y2 493 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DPP9Q86TI2 863 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 APBB2Q92870 758 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 WDCPQ9H6R7 721 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 GRID2O43424 1007 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TIMM44O43615 452 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DDHD2O94830 711 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 AP2A1O95782 977 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 GRIA3P42263 894 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGEA6P43360 314 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PSME3P61289 254 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC12A1Q13621 1099 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ANO4Q32M45 955 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 STEAP4Q687X5 459 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 VILLO15195 856 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 STMN1P16949 149 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ADRA1BP35368 520 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 WNT8BQ93098 351 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 NAT9Q9BTE0 207 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ARID2Q68CP9 1835 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TNFAIP8O95379 198 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TAS2R39P59534 338 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FUT11Q495W5 492 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 C4orf22Q6V702 233 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LPGAT1Q92604 370 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 MLNP12872 115 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PRKAA1Q13131 559 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CNSTQ6PJW8 725 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRC43Q8N309 656 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC29A1Q99808 456 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 SIKE1Q9BRV8 207 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 AP4S1Q9Y587 144 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ASLP04424 464 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNA5P22460 613 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGAP1Q07960 439 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM83EQ2M2I3 478 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM259Q4ZIN3 620 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 LCA5Q86VQ0 697 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 CYGBQ8WWM9 190 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRJ-202ENST00000440289 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms