RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 B4GALNT1Q00973 533 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 OLIG2Q13516 323 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 GRAPQ13588 217 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FBLN7Q53RD9 439 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT79Q5XKE5 535 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM160B2Q86V87 743 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 GHDCQ8N2G8 530 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N3U1 123 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FIBINQ8TAL6 211 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SGCDQ92629 289 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 HRH4Q9H3N8 390 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 ASAH2Q9NR71 780 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 HPF1Q9NWY4 346 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 A6NL46 340 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf100A8MU93 164 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L23D6RBM5 183 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 QSOX1O00391 747 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 DSCR3O14972 297 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 STRNO43815 780 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TMPRSS11DO60235 418 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 DIAPH2O60879 1101 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 HMMRO75330 724 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 AVILO75366 819 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TPPPO94811 219 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC4A1P02730 911 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TPOP07202 933 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 PDHA1P08559 390 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT10P13645 584 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 GATA3P23771 443 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CCR10P46092 362 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 NPY4RP50391 375 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CCR3P51677 355 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 JAK3P52333 1124 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 EFNA5P52803 228 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 GALCP54803 685 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CAP1Q01518 475 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 IL1RL1Q01638 556 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TAP1Q03518 808 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MESP2Q0VG99 397 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TNIP1Q15025 636 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 PPA1Q15181 289 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO43Q4G163 708 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNDC8Q6A555 127 aa4.86□□□□□ -1.63
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CBX1P4-201ENST00000439415 AADACL2Q6P093 401 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 LAS2Q8IYD9 372 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CARFQ8N187 725 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 DPP10Q8N608 796 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 AMER2Q8N7J2 671 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 XXYLT1Q8NBI6 393 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 MCUQ8NE86 351 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 CHST13Q8NET6 341 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNE4Q8WWG9 221 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF4BQ92750 862 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 R3HDM4Q96D70 268 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1P4-201ENST00000439415 AK8Q96MA6 479 aa4.86□□□□□ -1.63
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