RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADRB3P13945 408 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGB7P26010 798 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1E1P30953 314 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT9P35527 623 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSSP48449 732 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVPABLB-1P60509 514 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS21P63220 83 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEUP1Q05D60 604 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGL2Q14314 439 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOC3L4Q17RC7 722 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC31Q6UY01 552 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC47A2Q86VL8 602 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARGQ86W56 976 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR7D4Q8NG98 312 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFI44Q8TCB0 444 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK15Q8TD08 544 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNE4Q8WWG9 221 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMFQ96LC9 184 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC17A9Q9BYT1 436 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP44Q9C0F1 390 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCG4Q9H172 646 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCB1Q9NQ66 1216 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POM121BA6NF01 834 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BM21 787 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENDOD1O94919 500 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSF2P04141 144 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PON1P27169 355 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RABIFP47224 123 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHDQ02161 417 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZD2Q14332 565 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RETSATQ6NUM9 610 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF783Q6ZMS7 281 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5C3BQ969T7 300 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf74Q96LT6 269 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBCBQ99426 244 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPNE5Q9HCH3 593 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCL3Q9NQ33 180 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THSD1Q9NS62 852 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.43□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ILVBLA1L0T0 632 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN8A6NHC0 703 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD51BO15315 384 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMPSTE24O75844 475 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F9P00740 461 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCN1P35523 988 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARF5P84085 180 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISXQ2M1V0 245 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCPIP1Q96JH7 1222 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FEM1CQ96JP0 617 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEPHQ9BQS7 1158 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPON2Q9BUD6 331 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP13A1Q9HD20 1204 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIX2Q9NPC8 291 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RWDD2AQ9UIY3 292 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TENM4Q6N022 2769 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK10O43240 276 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP1G1O43747 822 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGM2P21980 687 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 L1CAMP32004 1257 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCNN1AP37088 669 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC20A2Q08357 652 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN3Q16667 212 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A52Q3SY17 297 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARD16Q5EG05 197 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARTNQ5T4W7 220 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP40Q5TG30 622 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WBP1Q96G27 269 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM51Q9NW97 253 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms