RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 MYL4P12829 197 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 PGAM1P18669 254 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 KRT15P19012 456 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SLC6A4P31645 630 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ETFBP38117 255 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 GRIA1P42261 906 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 IRAK1P51617 712 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ERVFC1P60507 584 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SLC7A9P82251 487 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CYP4F8P98187 520 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 IL10RBQ08334 325 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ITKQ08881 620 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CDH17Q12864 832 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SERINC3Q13530 473 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SPARCL1Q14515 664 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TMED2Q15363 201 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ARTNQ5T4W7 220 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 LGSNQ5TDP6 509 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 MARC1Q5VT66 337 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TXNDC8Q6A555 127 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CYS1Q717R9 158 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF534Q76KX8 674 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CNTD1Q8N815 330 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 MAML1Q92585 1016 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CDKL2Q92772 493 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CORO1BQ9BR76 489 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CASS4Q9NQ75 786 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TBK1Q9UHD2 729 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CPQQ9Y646 472 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TSC2P49815 1807 aa6.75□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 COL4A6Q14031 1691 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ILVBLA1L0T0 632 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 H0Y626 953 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 J3KR12 359 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TSPAN3O60637 253 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 PRAMEF11O60813 436 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CSPG5O95196 566 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 KLKB1P03952 638 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-DQB2P05538 268 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CKMP06732 381 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 RHOCP08134 193 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 PTPN2P17706 415 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 MGAT1P26572 445 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 HOXA9P31269 272 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 CLCN4P51793 760 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 OXCT1P55809 520 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 GNGT1P63211 74 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 GNA12Q03113 381 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TNK2Q07912 1038 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 MPP3Q13368 585 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 NAB1Q13506 487 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF235Q14590 738 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ARMC3Q5W041 872 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 STEAP4Q687X5 459 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 KCTD11Q693B1 232 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 IL31Q6EBC2 164 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 GAREM2Q75VX8 874 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.74□□□□□ -1.33
HDAC8-211ENST00000415409 TMC8Q8IU68 726 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms