RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAP25Q8TEE9 199 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEC14L1Q92503 715 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHF12Q96QT6 1004 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT12Q99456 494 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DUSP16Q9BY84 665 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYNCQ9H7C4 482 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDH9Q9ULB4 789 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.8□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRBAP50851 2863 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 F8VP50 259 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EFSO43281 561 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAD51CO43502 376 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DFNA5O60443 496 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHF2O75151 1096 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDGFRBP09619 1106 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACADMP11310 421 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCSK1P29120 753 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHRNA3P32297 505 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACSL1P33121 698 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCK1P35558 622 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LSSP48449 732 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C21orf59P57076 290 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USP46P62068 366 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSPY1Q01534 308 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC6A3Q01959 620 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ILKQ13418 452 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAZQ16635 292 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAP9Q49MG5 647 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFT20Q8IY31 132 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FUKQ8N0W3 1084 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRELID2Q8N945 189 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLCO2A1Q92959 643 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNPY3Q9BT09 278 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC19Q9H756 370 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THSD1Q9NS62 852 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BSNQ9UPA5 3926 aa9.79□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM187AA6NFU0 413 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TULP2O00295 520 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GFRA2O00451 464 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAP2K7O14733 419 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HCRTO43612 131 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRCH4O75427 683 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLI1P08151 1106 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT7P08729 469 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC130P13994 396 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CKMT2P17540 419 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMA2P25787 234 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CETN2P41208 172 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FNTAP49354 379 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOXK1P85037 733 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BNIP3Q12983 259 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STARD3Q14849 445 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AADACL2Q6P093 401 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms