RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 GABRB3P28472 473 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 EPHB1P54762 984 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB10P61026 200 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 TUSC3Q13454 348 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa23.41■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 LOC100653049A0A140TA62 436 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 TK2O00142 265 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT34O76011 436 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 MPSTP25325 297 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 KCTD4Q8WVF5 259 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 OR52B2Q96RD2 323 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 IZUMO2Q6UXV1 221 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 DHDDSQ86SQ9 333 aa23.39■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
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RABGGTA-202ENST00000399409 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.39■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A087X1B8 175 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A0U1RQF3 1178 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC78A2IDD5 438 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
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RABGGTA-202ENST00000399409 TRPV1Q8NER1 839 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 SPC25Q9HBM1 224 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.334e-8■■■■□ 23.7
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RABGGTA-202ENST00000399409 NEBLO76041 1014 aa23.38■■□□□ 1.33
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RABGGTA-202ENST00000399409 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 GATA6Q92908 595 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM209Q96SK2 561 aa23.38■■□□□ 1.33
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RABGGTA-202ENST00000399409 TREX1Q9NSU2 369 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-202ENST00000399409 WASH4PA8MWX3 477 aa23.38■■□□□ 1.33
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