RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAVIN2O95810 425 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRSS56P0CW18 603 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CKMT1AP12532 417 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 BTF3P20290 206 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 DRD3P35462 400 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP2J2P51589 502 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPS1Q13098 491 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDSS1Q5T2R2 415 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM69BQ5VUD6 431 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT28Q7Z3Y7 464 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT27Q7Z3Y8 459 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TICAM1Q8IUC6 712 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNRF4Q8WWF5 429 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TM9SF4Q92544 642 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TANKQ92844 425 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM18Q96B42 140 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 C3orf30Q96M34 536 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAP3K14Q99558 947 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM51Q9NW97 253 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAPN11Q9UMQ6 739 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNTN6Q9UQ52 1028 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0G2JLW4 131 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 hDV102S1A0JD36 115 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 GABRDO14764 452 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 DHRS4L1P0CG22 281 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDH1P12830 882 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC7A1P30825 629 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP4A11Q02928 519 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 NCAPH2Q6IBW4 605 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRC1Q9BTT6 524 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC52A3Q9NQ40 469 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL1Q9NR64 748 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 SACM1LQ9NTJ5 587 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXO28Q9NVF7 368 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2orf42Q9NWW7 574 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 NYAP2Q9P242 653 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CACNG5Q9UF02 275 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLK13Q9UKR3 277 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRHDEQ9UKU6 1024 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2CD2Q9Y426 696 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 LOXL2Q9Y4K0 774 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAF1P21675 1872 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF587BE7ETH6 402 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TIMM23O14925 209 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 KAT7O95251 611 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 VNN2O95498 520 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TERF1P54274 439 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 P3H1Q32P28 736 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 SATL1Q86VE3 508 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 RBFAQ8N0V3 343 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 AADATQ8N5Z0 425 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDHD1Q8NEL9 900 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAR2Q96K12 515 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRFN5Q96NI6 719 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMOD4Q9NZQ9 345 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNMTO43148 476 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TYMPP19971 482 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADPRHP54922 357 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHAGQ02094 409 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPN21Q16825 1174 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLK5Q496M5 336 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCAF6Q58WW2 860 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 DOK6Q6PKX4 331 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 C16orf89Q6UX73 402 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 SERPINA11Q86U17 422 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 STPG4Q8N801 248 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM58Q8NG06 486 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRHL3Q8TE85 626 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CPT1BQ92523 772 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF354BQ96LW1 612 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 NT5C1BQ96P26 610 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHST8Q9H2A9 424 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 FKRPQ9H9S5 495 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPR83Q9NYM4 423 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZIM2Q9NZV7 527 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms