RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 MAPRE2Q15555 327 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CMC1Q7Z7K0 106 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 NAT8LQ8N9F0 302 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MYH10P35580 1976 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087X1B8 175 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 IRAK2O43187 625 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 DDHD2O94830 711 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 RBP1P09455 135 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 RHOQP17081 205 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 GRIA1P42261 906 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 AP2B1P63010 937 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 BTKQ06187 659 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TTC23LQ6PF05 361 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PQLC3Q8N755 202 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 FOPNLQ96NB1 174 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SNX15Q9NRS6 342 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 IRAK4Q9NWZ3 460 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MEI4A8MW99 385 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 AP2A1O95782 977 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MT-CO1P00395 513 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 OR10T2Q8NGX3 314 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PSMG2Q969U7 264 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CMTM5Q96DZ9 223 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 UGT1A9O60656 530 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 NQO1P15559 274 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MAP2K2P36507 400 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 GALNTL6Q49A17 601 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 GPR158Q5T848 1215 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CNKSR3Q6P9H4 555 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC49Q8IUZ0 686 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TNS4Q8IZW8 715 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CYP4X1Q8N118 509 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM174Q8WUU8 243 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SLCO2A1Q92959 643 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 Q9H521 79 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 UGT1A7Q9HAW7 530 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 UGT1A10Q9HAW8 530 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 UGT1A8Q9HAW9 530 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 THAP1Q9NVV9 213 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.15□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 CFAP99D6REC4 459 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 ACSL4O60488 711 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 GRK2P25098 689 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 OLIG2Q13516 323 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 OR7D4Q8NG98 312 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 ARMCX1Q9P291 453 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 SMCHD1A6NHR9 2005 aa10.15□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 F8W810 466 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 OASLQ15646 514 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 TBCCQ15814 346 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 PARP15Q460N3 678 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 TMTC4Q5T4D3 741 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 PGBD3Q8N328 593 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC126Q96EE4 140 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 CATSPER2Q96P56 530 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 DPP7Q9UHL4 492 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 BAG5Q9UL15 447 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 MATN3O15232 486 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 EFCAB14O75071 495 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 CREB1P16220 341 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 NMBRP28336 390 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 NUDT2P50583 147 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 SDCCAG3Q96C92 435 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 EFHD1Q9BUP0 239 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 ALG9Q9H6U8 611 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 CHKBQ9Y259 395 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 MGEA5O60502 916 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 SERPINB3P29508 390 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 SCNN1AP37088 669 aa10.14□□□□□ -0.79
TTPAL-202ENST00000372904 MFSD5Q6N075 450 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms