RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ABRAQ8N0Z2 381 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MMP21Q8N119 569 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PLD5Q8N7P1 536 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 UXS1Q8NBZ7 420 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NETO2Q8NC67 525 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 VPS33AQ96AX1 596 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MCRS1Q96EZ8 462 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NDC1Q9BTX1 674 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FOXP3Q9BZS1 431 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MROH8Q9H579 483 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 JKAMPQ9P055 326 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 EMC3Q9P0I2 261 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP2.6□□□□□ -1.993e-6■■□□□ 12.1
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN7Q9Y6W3 813 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RLFQ13129 1914 aa2.6□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MROH5Q6ZUA9 1318 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FEZF1A0PJY2 475 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF839A8K0R7 811 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PTGES3LE9PB15 166 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 IFNL4K9M1U5 179 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 STX6O43752 255 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D4O60343 1298 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SUPT3HO75486 399 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CTAG2O75638 210 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SEC14L2O76054 403 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 STAMBPO95630 424 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KLKB1P03952 638 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MYL6BP14649 208 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 EZRP15311 586 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 AVPR2P30518 371 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RFC4P35249 363 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NPY4RP50391 375 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PMS2P54278 862 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NAGLUP54802 743 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FOXL2P58012 376 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 COG7P83436 770 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ALCAMQ13740 583 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF7Q14155 803 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ACOX1Q15067 660 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NOMO1Q15155 1222 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAM187BQ17R55 369 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CR1LQ2VPA4 569 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC27A1Q6PCB7 646 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RRAGAQ7L523 313 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KBTBD6Q86V97 674 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SHISA5Q8N114 240 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 AMER3Q8N944 861 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC148Q8NFR7 591 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SCFD2Q8WU76 684 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FBLIM1Q8WUP2 373 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SEC14L1Q92503 715 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RMDN1Q96DB5 314 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC46Q96FV0 321 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PRAM1Q96QH2 718 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TTPALQ9BTX7 342 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ACAT2Q9BWD1 397 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 B3GNT4Q9C0J1 378 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 XYLT2Q9H1B5 865 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SIRT5Q9NXA8 310 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CNIH4Q9P003 139 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ACTR3BQ9P1U1 418 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRSQ13332 1948 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAM205AQ6ZU69 1335 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ENO4A6NNW6 628 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CTIFO43310 598 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NEMFO60524 1076 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KERAO60938 352 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DDHD2O94830 711 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ADRA2CP18825 462 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DDCP20711 480 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 EFNA5P52803 228 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CDH8P55286 799 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KCNJ10P78508 379 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TAP1Q03518 808 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MYO1EQ12965 1108 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RPA4Q13156 261 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MPP3Q13368 585 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GRAPQ13588 217 aa2.59□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RAB32Q13637 225 aa2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms