RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 KCNK12Q9HB15 430 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO10Q9UK96 956 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CD160O95971 181 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TPSB2P20231 275 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 DMC1Q14565 340 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TPSAB1Q15661 275 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PSKH2Q96QS6 385 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 DEC1Q9P2X7 70 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MUSKO15146 869 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ANXA9O76027 345 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MT-CO1P00395 513 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SLC6A11P48066 632 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CYTH1Q15438 398 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GEN1Q17RS7 908 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GAB4Q2WGN9 574 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 EXOC2Q96KP1 924 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CISD3P0C7P0 127 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 DSC2Q02487 901 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 KDSRQ06136 332 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 HIF1AQ16665 826 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MBLAC2Q68D91 279 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CAVIN3Q969G5 261 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SEMA3CQ99985 751 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 K7ERQ8 282 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 AP2A1O95782 977 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ASGR2P07307 311 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 GJA4P35212 333 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CD86P42081 329 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ARL4CP56559 192 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 RHOAP61586 193 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CDK16Q00536 496 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SULT2A1Q06520 285 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MTM1Q13496 603 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SPARCL1Q14515 664 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MGME1Q9BQP7 344 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CIPCQ9C0C6 399 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 GEMP55040 296 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ECT2LQ008S8 904 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 RNF135Q8IUD6 432 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NXPE3Q969Y0 559 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ARNTLO00327 626 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PMPCBO75439 489 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 GJB3O75712 270 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 RGRP47804 291 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SLC20A2Q08357 652 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM215Q68D42 235 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CENPUQ71F23 418 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PDIK1LQ8N165 341 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MCUQ8NE86 351 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 IPMKQ8NFU5 416 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SERPINB12Q96P63 405 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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