RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 H7C2Y5 167 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RLN1P04808 185 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OMPP47874 163 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAM47BQ8NA70 645 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OR2T3Q8NH03 318 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PRKG2Q13237 762 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SPATS1Q496A3 300 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF607Q96SK3 696 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 H7C1W4 665 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ITGA10O75578 1167 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ATL1Q8WXF7 558 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L10C9JJH3 530 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HDAC3O15379 428 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PRKD3O94806 890 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LRRC38Q5VT99 294 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.32□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ARF5P84085 180 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SERPINB7O75635 380 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LYNP07948 512 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC11A2P49281 568 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OXCT1P55809 520 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PSMD5Q16401 504 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 COMMD2Q86X83 199 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 WDCPQ9H6R7 721 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAXCQ5TGI0 409 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LZTR1Q8N653 840 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ABCC3O15438 1527 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 IFNGP01579 166 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GPIP06744 558 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PIK3CBP42338 1070 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GCNT1Q02742 428 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OCLNQ16625 522 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PGRP06401 933 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MYBP10242 640 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CPB1P15086 417 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ITGB6P18564 788 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NTSP30990 170 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PANX3Q96QZ0 392 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SNX6Q9UNH7 406 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DPPA5A6NC42 116 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GRAP2O75791 330 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ETS2P15036 469 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SIK1P57059 783 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 E2F2Q14209 437 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CSHL1Q14406 222 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SBK1Q52WX2 424 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC9A6Q92581 669 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NACC2Q96BF6 587 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RNF146Q9NTX7 359 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC30A4O14863 429 aa8.31□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SEC22BO75396 215 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms