RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TPP1O14773 563 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 GJB3O75712 270 aa18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 FGBP02675 491 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 PPP3CCP48454 512 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 CDH4P55283 916 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 GNA12Q03113 381 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 TNK2Q07912 1038 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 RABGAP1LQ5R372 815 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 GRTP1Q5TC63 336 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 ATP2A3Q93084 1043 aa18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 MKS1Q9NXB0 559 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 ACTL7AQ9Y615 435 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-201ENST00000331789 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
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ACTB-201ENST00000331789 ABCG1P45844 678 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 PDE1BQ01064 536 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.14■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 PTPRN2Q92932 1015 aa18.14■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 MANSC1Q9H8J5 431 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 IL21Q9HBE4 155 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 PDFQ9HBH1 243 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 EDF1O60869 148 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CRHR1P34998 444 aa18.13■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 CORO7P57737 925 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ADGRF1Q5T601 910 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 TXNDC8Q6A555 127 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 BADQ92934 168 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 RBBP8Q99708 897 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 SPON2Q9BUD6 331 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 MAGEH1Q9H213 219 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ATP13A1Q9HD20 1204 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.13■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 IL31Q6EBC2 164 aa18.13■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ARMC2Q8NEN0 867 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 GRAMD1AQ96CP6 724 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 MAFFQ9ULX9 164 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 STARD13Q9Y3M8 1113 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 DENND4CQ5VZ89 1909 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CLDN11O75508 207 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CSPG5O95196 566 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 BGNP21810 368 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 SPRP35270 261 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 GMPRP36959 345 aa18.12■□□□□ 0.49
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ACTB-201ENST00000331789 DCLK2Q8N568 766 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CCDC63Q8NA47 563 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CCT6BQ92526 530 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 TADA1Q96BN2 335 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 SEMA3CQ99985 751 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 VPS45Q9NRW7 570 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ALPK3Q96L96 1907 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 NEFHP12036 1026 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ZXDBP98169 803 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 CREMQ03060 361 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-201ENST00000331789 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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