RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 FBXL22Q6P050 247 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RAPH1Q70E73 1250 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 J3KR12 359 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D4O60343 1298 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 IGSF8Q969P0 613 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 HCSTQ9UBK5 93 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 MID2Q9UJV3 735 aa22.04■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 ITKQ08881 620 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 PCSK7Q16549 785 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RTP2Q5QGT7 225 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ARMC3Q5W041 872 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 KDELC1Q6UW63 502 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 EBF4Q9BQW3 602 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.03■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 VPS45Q9NRW7 570 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 TREX1Q9NSU2 369 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SAT1P21673 171 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 ARNTP27540 789 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RING1Q06587 406 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 DUSP4Q13115 394 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 SEPT6Q14141 434 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 CNGA3Q16281 694 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-201ENST00000323374 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 TTPALQ9BTX7 342 aa22.02■■□□□ 1.12
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SPHK1-201ENST00000323374 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
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SPHK1-201ENST00000323374 GSC2O15499 205 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SIN3BO75182 1162 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CHRNA4P43681 627 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CTBP1Q13363 440 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SLC12A1Q13621 1099 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PSMG2Q969U7 264 aa22.01■■□□□ 1.11
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