RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 DSC2Q02487 901 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 GNA12Q03113 381 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 FPGSQ05932 587 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 POU6F1Q14863 301 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 ARMC3Q5W041 872 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 PDPK2PQ6A1A2 396 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 RBBP8Q99708 897 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 SLC13A1Q9BZW2 595 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 ARNT2Q9HBZ2 717 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 ATP13A1Q9HD20 1204 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 PHTF1Q9UMS5 762 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 STARD13Q9Y3M8 1113 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 TCAF1Q9Y4C2 921 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 MIA3Q5JRA6 1907 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 WDR91A4D1P6 747 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 EDF1O60869 148 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 F11P03951 625 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 MMP2P08253 660 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CORO7P57737 925 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 RPS24P62847 133 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 PCSK7Q16549 785 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRF1Q5T601 910 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CHST9Q7L1S5 443 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 PGBD5Q8N414 524 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 TADA1Q96BN2 335 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 OBSL1O75147 1896 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 TPP1O14773 563 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 FGBP02675 491 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SPRP35270 261 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINB4P48594 390 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC121Q6ZUS5 278 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 STRA8Q7Z7C7 330 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 OTUD6BQ8N6M0 293 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ARRDC2Q8TBH0 407 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 WBP2Q969T9 261 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF778Q96MU6 729 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 AGAP2Q99490 1192 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 IL21Q9HBE4 155 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 PRKAG3Q9UGI9 489 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ASB3Q9Y575 518 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD65E5RJM6 399 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 LIMK2P53671 638 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0D9SEW6 157 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 LATS1O95835 1130 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SYN1P17600 705 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CA8P35219 290 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ETFBP38117 255 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CHRNA4P43681 627 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 PDE1BQ01064 536 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 HERC6Q8IVU3 1022 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ISL2Q96A47 359 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ATXN3LQ9H3M9 355 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 MANSC1Q9H8J5 431 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 STOML2Q9UJZ1 356 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GVM2 712 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 TCAF2A6NFQ2 919 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 TGM5O43548 720 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31D3P0C874 917 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SGSHP51688 502 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF235Q14590 738 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 KDELC2Q7Z4H8 507 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 OR7D4Q8NG98 312 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 PLCD4Q9BRC7 762 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 TRPC7Q9HCX4 862 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CCT8L1PA6NM43 557 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 OLFM2O95897 454 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL23Q8NBE8 558 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 PRKD2Q9BZL6 878 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SMPD4Q9NXE4 827 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 INSL6Q9Y581 213 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ILVBLA1L0T0 632 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC78A2IDD5 438 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 RHOCP08134 193 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 IHHQ14623 411 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 STXBP5Q5T5C0 1151 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 IL31Q6EBC2 164 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms