RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CYP4X1Q8N118 509 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 NLNQ9BYT8 704 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 LHX5Q9H2C1 402 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 C16orf96A6NNT2 1141 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 H3BMM5 538 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TPP1O14773 563 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PIGNO95427 931 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 EPHX1P07099 455 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CRTC3Q6UUV7 619 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 STRADAQ7RTN6 431 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TEX9Q8N6V9 391 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 RNF148Q8N7C7 305 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CLIP3Q96DZ5 547 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ACAT2Q9BWD1 397 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ZW10O43264 779 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 AVILO75366 819 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PPP2R1BP30154 601 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 SP2Q02086 613 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 MAGEC3Q8TD91 643 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 SELENOMQ8WWX9 145 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 SNX27Q96L92 541 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ACBD6Q9BR61 282 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TBC1D14Q9P2M4 693 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ADAMTS3O15072 1205 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ATP6V1B2P21281 511 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TTPAP49638 278 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PEX5P50542 639 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 UBE3AQ05086 875 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ALLCQ8N6M5 410 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 COPS8Q99627 209 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 FBXO5Q9UKT4 447 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CPQQ9Y646 472 aa10.79□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PLIN4Q96Q06 1357 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ARVCFO00192 962 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TSPAN8P19075 237 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TFEBP19484 476 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 RPS7P62081 194 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 GBE1Q04446 702 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PPP2R2DQ66LE6 453 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 AUTS2Q8WXX7 1259 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TSC22D3Q99576 134 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 THAP1Q9NVV9 213 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PHLPP1O60346 1717 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 FFAR3O14843 346 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 GPR42O15529 346 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 NUDT14O95848 222 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 EOMESO95936 686 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 IMPDH2P12268 514 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CCL5P13501 91 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TRPC1P48995 793 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TAF5Q15542 800 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TMEM192Q8IY95 271 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 SH3GL1Q99961 368 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 MAP10Q9P2G4 905 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PIK3C2AO00443 1686 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PTPRJQ12913 1337 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CASZ1Q86V15 1759 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 MEI4A8MW99 385 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ISM1B1AKI9 464 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 APODP05090 189 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PRKAG1P54619 331 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 MPPE1Q53F39 396 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 ALFQ53S48 1182 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 XYLT1Q86Y38 959 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TRPC4APQ8TEL6 797 aa10.78□□□□□ -0.68
TMX3-201ENST00000299608 TFAP2BQ92481 460 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms