RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 DNASE1L2Q92874 299 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MATN3O15232 486 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NEBLO76041 1014 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NFKB1P19838 968 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PSMB4P28070 264 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MMP13P45452 471 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 RHOAP61586 193 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 FZD5Q13467 585 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ZNF235Q14590 738 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PTPRN2Q92932 1015 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PWWP2AQ96N64 755 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 A8MX80 341 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CHRNB1P11230 501 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 COL9A1P20849 921 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CCNCP24863 283 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 GRIA1P42261 906 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 IL10RBQ08334 325 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CCDC89Q8N998 374 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TTC13Q8NBP0 860 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 FRS2Q8WU20 508 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ACDQ96AP0 544 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SEMA3CQ99985 751 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SLC2A11Q9BYW1 496 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 DPH5Q9H2P9 285 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NOD2Q9HC29 1040 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SARDHQ9UL12 918 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 SIN3BO75182 1162 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 PMPCBO75439 489 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CTSLP07711 333 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CTAGE8P0CG41 777 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CD86P42081 329 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 ZXDAP98168 799 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 DR1Q01658 176 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 PPP1R7Q15435 360 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 TEX44Q53QW1 395 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 TEX35Q5T0J7 233 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 DENND2CQ68D51 928 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 RETSATQ6NUM9 610 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 TTC17Q96AE7 1141 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 VOPP1Q96AW1 172 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 TMEM51Q9NW97 253 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 LHX3Q9UBR4 397 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 WNT16Q9UBV4 365 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.02□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 ITGAVP06756 1048 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 PDHA1P08559 390 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 PIRTP0C851 137 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 ITIH2P19823 946 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CHRNA4P43681 627 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPA-201ENST00000260116 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms