RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 PLOD3O60568 738 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 VIL1P09327 827 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 CCNG2Q16589 344 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GIT2Q14161 759 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ACTL9Q8TC94 416 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 Q96MT0 163 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ASAH2Q9NR71 780 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TGFB3P10600 412 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ITPKBP27987 946 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 METTL7BQ6UX53 244 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 DENND1CQ8IV53 801 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MARK4Q96L34 752 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 UBE2QL1A1L167 161 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GP5P40197 560 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 CD86P42081 329 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MPPE1Q53F39 396 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 VPS35Q96QK1 796 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ABCA6Q8N139 1617 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 H3BNH8 94 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GPR156Q8NFN8 814 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ZFP28Q8NHY6 868 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 VPS4AQ9UN37 437 aa16.62■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TBL1XO60907 577 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 HOXC12P31275 282 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ELK3P41970 407 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 USP41Q3LFD5 358 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1W2PRG6 482 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 LACTBL1A8MY62 500 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TNFRSF21O75509 655 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SERPINE1P05121 402 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 LZTR1Q8N653 840 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 LENG9Q96B70 501 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GCATO75600 419 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 UBOX5O94941 541 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 PTPN4P29074 926 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 C1orf50Q9BV19 199 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TATDN2Q93075 761 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 IL22Q9GZX6 179 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TFPIP10646 304 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 TTC7BQ86TV6 843 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 FAM129BQ96TA1 746 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.61■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 GZMAP12544 262 aa16.6■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 XKR6Q5GH73 641 aa16.6■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.6■□□□□ 0.25
LAMC1-201ENST00000258341 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms